1910－1911年東北鼠疫的死者

順治四年（1647）夏秋，「江西撫州大疫，屍相枕籍，死數萬人。」（光緒《撫州府志》卷84）

康熙九年（1670）正月靈川大疫。（《清史稿》）

康熙二十一年（1682）五月，榆次疫。（《清史稿》）

康熙三十二年（1693）七月，德平大疫。（《清史稿》）

康熙四十一年（1702）三月，連州疫。（《清史稿》）

康熙五十六年（1717）正月，天台疫。（《清史稿》）

雍正元年（1723）秋，平鄉大疫，死者無算。（《清史稿》）

乾隆五年（1740）瘟疫流行，民有死亡。（《通渭縣誌》）

乾隆十年（1745）十一月，棗陽大疫。（《清史稿》）

乾隆三十二年（1767）八月，嘉善大疫。（《清史稿》）

乾隆四十年（1775）春，武強大疫。（《清史稿》）

咸豐五年（1855年）六月，雲南清水大疫（鼠疫），是全球性的「第三次鼠疫大流行」的開端。六年五月，湖北咸寧大疫。十一年春，山東即墨大疫。六月，山東黃縣大疫。[26]

同治元年（1862年），「太平天國」戰區中出現嚴重霍亂疫情，屬於全球性的「第四次霍亂大流行」的疫情。

同治二年（1863年），六月，上海疫疾流行，死亡二萬餘人。夏天，陝西瘟疫流傳。余澍疇《秦隴回務紀略》記陝西的疫情：「自夏徂秋，疫癘大作，死亡甚多，至有全家無一生者。」

俞樾的《曲園筆記》記載，「同治之初，滇中大亂，賊所到之處，殺人如麻，白骨飛野；通都大邑，悉成坵墟。亂定之後，孓遺之民，稍稍復集，掃除胔骼；經營苫蓋。時則又有大疫，疫之將作，其家之鼠，無故自斃，……人不及見，久而腐爛，人聞其臭，鮮不疾者，病皆驟然而起，……或逾日死，或即日死，諸醫束手，不能處方；……其得活者，千百中一二而已。疫起鄉間，延及城市，一家有病者，則其左右十數家即遷移避之，踣於道者無算，然卒不能免也。甚至闔門同盡，比戶皆空，小村聚中，絕無人跡……」

光緒十六年（1890年）秋，北京有大疫[27]，當時的重臣潘祖蔭、曾國荃、曾紀澤、彭玉麟、楊岳斌等皆病逝。戶部左侍郎孫詒經患重病，「痰喘甚重」，不久去世。翁同龢在日記中說:「七日之中兩哭吾友，傷已，子授亦諒直之友哉。」光緒十六年十一月二十一日醇親王奕譞病逝。李鴻章的女婿張佩綸因服用金雞納霜痊癒。

1855年，咸豐年間，雲南爆發鼠疫，引發全球性第三次鼠疫大流行，造成全球1000-1500萬人死亡。

光緒二十年（1894年），鼠疫曾發現於香港，後即釀成疫癘[28]，並造成大流行，與1855年雲南清水鼠疫有間接關係。

宣統二年（1910年），東北爆發鼠疫。伍連德的《伍連德自傳》記載「這種病（鼠疫）……滿州里一帶的俄國人恐是最先染到的。有一部份以捕土撥鼠為之山東移民，患得更多。他們將鼠捕來，剝取其皮，染以顏色，冒充黑貂，售與西方婦女。……一俟有了二三十條鼠皮，即往客棧居住，靜候顧主之光臨。如果一人患有疫疾，即可傳染整個客棧，再延至他處。」

光緒二十八年（1902年）六月，京津等多地爆發大規模霍亂疫情，屬於全球性的「第六次霍亂大流行」疫情，杭州地區死亡超過一萬餘人。[29][30] 直隸總督袁世凱在六月初十日給徐世昌的信函中說：「近日疫症大作，傷人甚多。」